博科园AI人工智能助手
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专题一:CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接
带您一步步实操学习蛋白结构分析、同源建模、虚拟筛选、分子对接、药效团模型、定量构效关系、碎片化药物设计、Gromacs 分子动力学模拟与结果分析,并以实例讲解与练习为主,达到即学即用效果,帮助学员系统掌握计算机辅助药物设计技术,助力学术研究
从AMBER程序入门学会编译方法,安装自己的AMBER可执行程序开始,依次讲授研究对象模型的获取与构建-体系预处理、能量优化、分子动力学模拟结果评估、结合自由能计算、相互作用机理分析、可视化、轨迹特征获取,并对经典文献进行复现。
专题三:GROMACS分子动力学蛋白模拟、药物开发溶剂筛选
从GROMACS程序入门学会编译方法,安装自己的GROMACS可执行程序开始,依次讲授生物体系简单到复杂的建模与TOP文件构建、常用模拟结果分析、水溶性蛋白质和配体作用分子动力学模拟过程及结果分析、生物膜磷脂双分子层生物膜、膜蛋白等建模分析、蛋白质结合自由能计算、药物分子开发溶剂筛选。
通过机器学习、深度学习的分类回归任务、 分子特征、模型评估、参数优化与模型选择、浅层机器学习分类虚拟筛选、集成机器学习方法、DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型实操以及结合相关课题的应用实践等内容,带您真正的进入人工智能药物发现的领域。